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中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用（202002AA100007）

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CC BY 4.0
元数据
主题 分子生物学数据
项目类型 战略性先导科技专项
项目名称 寄生植物
标题 寄生植物南方菟丝子基因组数据
标题(英) The genome data of parasitic plant Cuscuta australis
作者 孙桂玲，许宇星，刘晖，孙婷，张井雄，吴建强
作者(英) Guiling Sun, Yuxing Xu, Hui Liu, Ting Sun, Jingxiong Zhang & Jianqiang Wu
关键词 南方菟丝子、基因组、寄生植物
关键词(英) Cuscuta australis, Genome, Parasitic plant
摘要 中国科学院昆明植物研究所功能基因组学与利用团队吴建强研究组，以南方菟丝子（Cuscuta australis）为对象，通过全基因组和转录组测序，获得了首个寄生植物高质量参考基因组。并通过比较基因组学、分子进化等分析获得了大量信息，为了解寄生植物的演化、寄生植物与寄主间的互作提供了重要基础。
提交者 zhuanghuifu@mail.kib.ac.cn
提交时间 2018/11/9 16:20:18
联系方式 zhuanghuifu@mail.kib.ac.cn

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Cuscuta.genome.v1.1.fasta 258.63 MB 35
Protein.cDNA.fa 30.73 MB 36
Protein.cds.fa 23.01 MB 47
Protein.gff3 21.63 MB 34
Protein.pt.fa 7.86 MB 25
Pseudo.cds.fa 948.54 KB 19
Pseudo.gff3 805.65 KB 18
Pseudo.pt.fa 328.11 KB 20
Readme.txt 438.00 B 22
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Sun G, Xu Y, Liu H, et al. Large-scale gene losses underlie the genome evolution of parasitic plantCuscuta australis:[J]. Nature Communications, 2018, 9.

孙桂玲，许宇星，刘晖，孙婷，张井雄，吴建强 (2018). 寄生植物南方菟丝子基因组数据 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=f09a006d-6234-4e35-b5b4-ccae9afed27f
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