中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用(202002AA100007)

   数据列表

松属系统发育重建和时空演化

数据集作者: 金伟涛,魏晓新,汪小全 数据集关键词: 松属,转录组,序列矩阵,系统发育树...

数据集摘要:

该数据集主要包括259个转录组数据信息、筛选得到的1662个直系同源基因、基于1662个直系同源基因得到的系统发育树和时间树及系统发育主成分分析获得的PC1值。 访问数据>>

云杉属系统发育重建和进化历史

数据集作者: 邵成成,沈婷婷,冉进华,汪小全 数据集关键词: 云杉属,转录组,直系同源基因,树文件

数据集摘要:

该数据集主要包括转录组的测序数据、筛选得到的1141个直系同源基因、基于1141个直系同源基因得到的系统发育树及时间树。 访问数据>>

冷杉属转录组样本数据

数据集作者: 魏周睿,焦丹,魏晓新,汪小全 数据集关键词: 冷杉属,转录组,样本信息

数据集摘要:

用于构建冷杉属系统进化树的131个转录组数据的样本信息和原始测序数据信息 访问数据>>

云杉属青藏高原支系物种形成和进化历史

数据集作者: 沈婷婷,冉进华,汪小全 数据集关键词: 云杉属,青藏高原支系,转录组,SNP

数据集摘要:

该数据集主要包括转录组测序数据、用于系统进化树构建的DatasetI/DatasetII/DatasetIII 三个数据集的串联矩阵、DatasetII包含的819个直系同源基因、基于三种... 访问数据>>

华山松群体遗传和物种形成

数据集作者: 刘艳艳,魏晓新,汪小全 数据集关键词: 华山松,转录组,单拷贝核基因,SN...

数据集摘要:

该数据集包括华山松群体及其近缘物种共计67个转录组原始数据信息、CDS序列和矩阵、分别利用串联法和溯祖法建立的系统发育树、SNP多态性位点建立的vcf文件以及由四个单拷贝基因ARAL、FT... 访问数据>>

东亚亚热带五针松进化历史和物种形成

数据集作者: 刘艳艳,金伟涛,魏晓新,汪小全 数据集关键词: 东亚亚热带五针松,转录组,直系同源...

数据集摘要:

该数据集包括华山松及其近缘物种39个个体的转录组SRR序列号、CDS拼接序列、2606个直系同源基因矩阵、分别利用串联法和溯祖法建立的系统发育树以及用于生态位分析的物种分布点。 访问数据>>

海南五针松和华南五针松转录组

数据集作者: 刘畅,魏晓新,汪小全 数据集关键词: 海南五针松,华南五针松,转录组

数据集摘要:

该数据集包含55个海南五针和50个华南五针松转录组数据的样本信息和测序信息 访问数据>>