中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用(202002AA100007)

   数据列表

WGDI软件开发相关数据

数据集作者: 刘建全,孙朋川等 数据集关键词: 共线性分析,WGDI

数据集摘要:

研究者开发了一种基于动态规划算法的共线性提取,与MCScanX和JCVI比较分析发现,WGDI保留了更多同源基因对,以鉴定更长,更多的共线性区块。WGDI特别适用于识别频繁的多倍化事件(如... 访问数据>>

基于核,质体和线粒体数据集的基因组尺度被子植物系统发育相关实验分析数据

数据集作者: 刘建全,胡红印等 数据集关键词: 被子植物核基因,系统发育

数据集摘要:

收集整理了近20年发表的366个高质量被子植物de novo基因组,包含241属,97科和43目。根据三套基因组类型的全基因组水平的序列变化,第一次将同一物种的三套基因组各自的同源序列分别... 访问数据>>

拟南芥中CHYR1基因相关实验数据

数据集作者: 刘建全,刘唤唤等 数据集关键词: CHYR1泛素磷酸化,拟南芥免疫反应

数据集摘要:

对于植物而言,控制正常生长与响应病原菌的免疫之间的平衡是非常重要的。然而,平衡的基本分子机制仍然是未知的。我们报道了由拟南芥中WRKY70及其伴侣CHYR1控制的这种机制。 访问数据>>

桔梗科的叶绿体基因组数据

数据集作者: 李春姣,李德铢 数据集关键词: 桔梗科,叶绿体,基因组

数据集摘要:

中国科学院昆明植物研究所植物多样性与系统发育基因组学研究组,以桔梗科(Campanulaceae)为例,通过二代测序技术,获得了该科植物的叶绿体基因组。并通过比较基因组学、分子进化等分析获... 访问数据>>

石松科植物转录组测序数据

数据集作者: 杜新宇 左政裕 卢金梅 李德铢 数据集关键词: 石松科、转录组

数据集摘要:

石松科是解析维管植物重要组织和器官演化创新的关键类群,而开展基因组测序和基因时空表达分析是解析这一问题的有效手段。为了获取石松科植物基因组演化信息和关键基因的时空差异表达信息,本项目对灰白... 访问数据>>

蕨类植物二代浅层测序数据

数据集作者: 杜新宇 左政裕 卢金梅 李德铢 数据集关键词: 蕨类,浅层测序

数据集摘要:

由于大量蕨类植物缺乏质体基因组数据,水龙骨目(占现存蕨类80%以上物种)的系统发育关系及早期多样化模式不清。而开展二代浅层测序,组装质体基因组进行分析是解析这一问题的有效手段。本项目对水龙... 访问数据>>

石松科植物基因组调查数据

数据集作者: 杜新宇 左政裕 卢金梅 李德铢 数据集关键词: 石松科、基因组调查

数据集摘要:

石松科是解析维管植物重要组织和器官演化创新的关键类群,而开展基因组测序和基因时空表达分析是解析这一问题的有效手段。为了筛选参考基因组测序物种,本项目在前期系统发育分析和C值数据分析的基础上... 访问数据>>