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元数据

主题	XDB大尺度区域生物多样性
项目类型	XDB大尺度区域生物多样性
项目名称	中国西南地区生物多样性的演化历史与格局
(子)课题名称	喀斯特植物多样性起源与适应性进化
标题	斑叶草植物基因组三代，HiC测序及denovo组装数据
标题(英)	Third-generation sequencing, Hi-C sequencing, and de novo assembly data of Henckelia pumila genome.
作者	孔航辉、冯超
作者(英)	Hanghui Kong, Chao Feng
关键词	斑叶草植物,三代测序,数据质量评估, HiC技术辅助,结果统计
关键词(英)	Henckelia pumila, Third-generation sequencing, Hi-C sequencing, data statistics, quality control
摘要	通过PacBio Sequel测序平台对斑叶草植物DNA样品进行检测，在构建文库后进行质量检测，对数据进行质控后共获得284 Gb数据，以fastq格式保存。
摘要(英)	DNA sequencing of Henckelia pumila was conducted using the PacBio Sequel sequencing platform. After library construction and quality control, a total of 284 Gb of sequencing data was obtained, saved in fastq format.
提交者	赖玲
提交时间	2024/4/16 10:13:22
联系方式	lailing@scbg.ac.cn

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文件名	大小	操作
FRHC190074355-1a_L1_1.fq.gz	23.37 GB	2025/4/30 之后开放共享
FRHC190074355-1a_L1_2.fq.gz	24.22 GB	2025/4/30 之后开放共享
m64033_190723_074806.subreads.bam	236.89 GB	2025/4/30 之后开放共享
m64033_190723_074806.subreads.bam.pbi	68.21 MB	2025/4/30 之后开放共享
m64033_190723_074806.subreadset.xml	16.16 KB	2025/4/30 之后开放共享

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孔航辉、冯超 (2024). 斑叶草植物基因组三代，HiC测序及denovo组装数据 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=063e6cc2-be5b-1592-4541-70ba1e33e42a