中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用(202002AA100007)

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CC BY 4.0
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主题 XDB大尺度区域生物多样性
项目类型 中国科学院战略性先导科技专项(B类)
项目名称 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局
(子)课题名称 中国西南山地物种形成机制研究
标题 杨属的基因组数据
作者 李敏洁,张涵等
关键词 杨属重测序数据,基因渐渗
摘要 Populus alba (Pa),P. tremula (Pt) 和P. tremuloides (Ps) 是杨属的三个树种,在系统发育树中没有直接关系,Pa 最早分化,其次是 Pt 和 Ps 最近。这三个物种在形态上,生态上,地理上和遗传差异甚至存在生殖隔离 。有趣的是,在欧洲和亚洲的接触带中形成了 Pa 和 Pt 之间的两个大型“马赛克”混合带。记录了适应性差异通过内在和种群历史过程影响欧洲杂交区杂交种群之间的生殖隔离。Pa 和 Pt 之间存在的基因流动已得到广泛认可,尽管存在两个主要的未知数。渐渗的 DNA 片段在基因组中的分布位置以及这些渐渗区域中定位的基因类型仍然未知。值得注意的是,生活在 Pa 和 Pt 亚洲接触区的个体大多是它们的 F1 杂交种,P. canescens (Pc), 在 Pc 中观察到交配障碍。然而,杂交后这种交配后障碍的机制尚未得到很好的表征。因此,这三个谱系提供了一个很好的系统来研究这些未知数,由于与其他两个物种的基因交换相对缺乏,Ps 被用作比较。本数据集对 Pa,Pt (PtA) 和 Pc 的基因组进行了重新测序,还收集了来自北美 Ps 和欧洲 Pt (PtE) 的基因组数据
提交者 刘刚
提交时间 2024/7/5 16:05:47
联系方式 2217786138@qq.com

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李敏洁,张涵等 (2024). 杨属的基因组数据 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=12bbe100-d479-5672-c5b4-9a1a617ed3e7