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中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用（202002AA100007）

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CC BY 4.0
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主题 分子生物学数据
项目类型 国家自然科学基金
项目名称 多种寄生植物和菌异养植物基因组学数据库
标题 多种寄生植物和菌异养植物基因组学数据库
标题(英) Parasitic and Mycoheterotrophic plants genome database
作者 许宇星，雷云霆，张井雄，吴建强
作者(英) Yuxing Xu, Yunting Lei, Jinxiong Zhang, Jianqiang Wu
关键词 基因组，基因注释
摘要 中国科学院昆明植物研究所吴建强研究员带领的研究团队获取了寄生植物南方菟丝子（Cuscuta australis）、埃及列当（Phelipanche aegyptiaca）、向日葵列当（Orobanehe cumana）、钟萼草（Lindenbergia luchunensis），以及菌异养植物天麻（Gastrodia elata）的全基因组图谱。
摘要(英) Here we provide five high-quality genomes of orobanchaceous plants and Mycoheterotrophic, the autotrophic Lindenbergia luchunensis and the holoparasitic plants Phelipanche aegyptiaca, Orobanche cumana and Cuscuta australis and Mycoheterotrophic plant Gastrodia elata.
提交者 粟忠祥
提交时间 2023/5/13 11:04:24
联系方式 suzhongxiang19@mails.ucas.ac.cn

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aegyptiaca.genome.fasta 3.65 GB 0
aegyptiaca.gff 123.97 MB 0
cumana.genome.gff3 105.45 MB 0
Cuscuta.genome.v1.1.fasta 258.62 MB 0
Cuscuta.v1.1.gff3 22.42 MB 0
gastrodia.genome.fasta 1001.90 MB 4
gastrodia.genome.gff3 80.71 MB 1
Lindenbergia_luchunensis.genome.fasta 233.26 MB 0
Lindenbergia_luchunensis.gff 108.89 MB 0
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Xu Y, Zhang J, Ma C, Lei Y, Shen G, Jin J, Eaton DAR, Wu J. Comparative genomics of orobanchaceous species with different parasitic lifestyles reveals the origin and stepwise evolution of plant parasitism. Mol Plant. 2022 Aug 1;15(8):1384-1399. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.007. Epub 2022 Jul 18. PMID: 35854658. Xu Y, Lei Y, Su Z, Zhao M, Zhang J, Shen G, Wang L, Li J, Qi J, Wu J. A chromosome-scale Gastrodia elata genome and large-scale comparative genomic analysis indicate convergent evolution by gene loss in mycoheterotrophic and parasitic plants. Plant J. 2021 Dec;108(6):1609-1623. doi: 10.1111/tpj.15528. Epub 2021 Oct 26. PMID: 34647389.

许宇星，雷云霆，张井雄，吴建强 (2023). 多种寄生植物和菌异养植物基因组学数据库 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=20600006-d5cb-9e5c-5247-2d762d33bc2c
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