中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用(202002AA100007)

   资源信息
CSTR
公开级别
开放共享
资源类型
超大文件
资源热度
211 次浏览
共享协议
CC BY 4.0
元数据
主题 XDB大尺度区域生物多样性
项目类型 中国科学院战略性先导科技专项(B类)
项目名称 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局
(子)课题名称 物种形成过程中辐射分化模式和关键性状演变的遗传机制
标题 四齿芥样品建库测序
标题(英) Sequencing data of Tetracme quadricornis samples using PacBio Hifi and HI-C library construction.
作者 刘杰,周士钊,赵彬言
作者(英) Liu jie, Zhou shi-zhao, Zhao bin-yan
关键词 四齿芥样品,pacbio HiFl建库测序,HI-C建库测序,数据质控,数据统计,数据评估
关键词(英) Tetracme quadricornis samples, PacBio Hifi library construction, HI-C library construction, seguencing, data statistics, quality control
摘要 通过PacBio Hifi 、Hi-C测序平台对四齿芥样品进行检测,在构建文库后进行质量检测,对数据进行质控后共获得142 Gb数据,以fastg格式保存
摘要(英) The Tetracme quadricornis sample was tested using the PacBio HiFi and Hi-C sequencing platforms. After library construction and quality testing, a total of 142 Gb of data was obtained, which was saved in fastg format.
提交者 杨杨
提交时间 2024/6/14 17:34:55
联系方式 yangyang2@mail.kib.ac.cn

包含文件
文件名 大小 描述 下载次数 操作
CCS.rar 58.04 GB 0
HiC.rar 40.07 GB 0
在线服务URL
暂无在线服务
引用
当您使用此数据集时,请引用
" Liu et al., Genomes of Meniocus linifolius and Tetracme quadricornis reveal the ancestral karyotype and genomic fea- tures of core Brassicaceae, Plant Communications (2024), https://doi.org/10.1016/j.xplc.2024.100878"

刘杰,周士钊,赵彬言 (2024). 四齿芥样品建库测序 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=25381c64-f3b2-d7a3-4b0f-4cb69a56e058