中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

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生物资源数字化开发应用(202002AA100007)

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主题 其他科学数据
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项目名称 分子生物学实验平台2023年度基础数据汇交
标题 植物DNA条形码数据 (2023年)
作者 曾春霞
关键词 植物DNA条形码,rbcL,matK,trnH-psbA,psbK-psbI,ITS,种质资源,基础数据
摘要 植物DNA条形码数据库是物种准确鉴定的基础。植物核心条形码包括了rbcL、matK、trnH-psbA和ITS四个片段。目前主要通过两种方法获取植物DNA条形码数据,一是Sanger测序,选择通用引物,PCR扩增测序,获取目标DNA条形码数据;二是通过基因组浅层测序的方法,获得2 Gb左右的测序数据,原始数据组装拼接后,提取目标DNA 条形码数据。本次数据汇交的数据集是通过Sanger测序获取的目标DNA条形码。包含了植物DNA条形码数据库2023年新增的176种936份样品2718条DNA条形码序列。
提交者 zengcx
提交时间 2024/10/29 15:30:58
联系方式 zengcx@mail.kib.ac.cn

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DNA条形码数据汇交20241029.xlsx 71.53 KB 0 资源仅公开元数据
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曾春霞 (2024). 植物DNA条形码年度新增DNA条形码基础数据(2023年). Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS.

曾春霞 (2024). 植物DNA条形码数据 (2023年) . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=27ac754b-a999-a327-a279-082d1cb5e306