中国科学院昆明植物研究所科学数据中心

Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS

中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用（202002AA100007）

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元数据
主题 XDB大尺度区域生物多样性
项目类型 中国科学院战略性先导科技专项（B类）
项目名称 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局
(子)课题名称 中国西南山地物种形成机制研究
标题 川黔千金榆的基因组数据
作者 杨勇志，杨潇月
关键词 川黔千金榆，染色体级别基因组
摘要 我们对鹅耳枥Carpinus fangiana的基因组进行了测序。基于超过 75 Gb （~200x） 的高质量二代测序数据，我们组装了一个 386.19 Mb 的 C. fangiana 基因组， N50 大小为1.91 Mb。此外，使用超过 50 Gb （~130x） 的 Hi-C 测序数据将 357.84 Mb 的基因组锚定在 8 条染色体上。对代表6个组织的转录组进行测序，以便于基因注释，并为每个组织生成超过5.50 Gb的高质量数据。结构注释在组装的基因组中共鉴定出27,381个蛋白质编码基因，其中94.36%被功能注释。此外，还预测了 4,440 个非编码基因。
提交者 刘刚
提交时间 2024/7/5 16:06:55
联系方式 2217786138@qq.com

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在线服务URL
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引用
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杨勇志，杨潇月 (2024). 川黔千金榆的基因组数据 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=27f301f5-19f2-88e9-8608-b9c5c6aed7e8
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