主题 | XDB大尺度区域生物多样性 |
项目类型 | 中国科学院战略性先导科技专项(B类) |
项目名称 | 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局 |
(子)课题名称 | 中国西南山地物种形成机制研究 |
标题 | 伯乐树的基因组数据 |
作者 | 杨勇志,张涵等 |
关键词 | 伯乐树基因组,WGD,基因功能 |
摘要 | 伯乐树又名钟萼木,山桃花,为第三纪孑遗植物,隶属于叠珠树科(Akaniaceae)。伯乐树以中国为分布中心,零星散布于长江以南省区的森林中,1999年被列为国家一级重点保护野生植物。结合二代短读长DNBseq与三代长读长PacBio HiFi测序技术,从头组装了伯乐树基因组,最终得到1,213.76 Mb 基因组组装结果,与K-mer预测基因组大小基本一致,基因组contig N50高达64.13Mb。并进一步分析了有效群体历史动态演变,为解析伯乐树濒临因素和未来保护提供了重要参考。 |
提交者 | 刘刚 |
提交时间 | 2024/7/5 16:06:15 |
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