中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用(202002AA100007)

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主题 XDB大尺度区域生物多样性
项目类型 中国科学院战略性先导科技专项(B类)
项目名称 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局
(子)课题名称 中国西南山地物种形成机制研究
标题 伯乐树的基因组数据
作者 杨勇志,张涵等
关键词 伯乐树基因组,WGD,基因功能
摘要 伯乐树又名钟萼木,山桃花,为第三纪孑遗植物,隶属于叠珠树科(Akaniaceae)。伯乐树以中国为分布中心,零星散布于长江以南省区的森林中,1999年被列为国家一级重点保护野生植物。结合二代短读长DNBseq与三代长读长PacBio HiFi测序技术,从头组装了伯乐树基因组,最终得到1,213.76 Mb 基因组组装结果,与K-mer预测基因组大小基本一致,基因组contig N50高达64.13Mb。并进一步分析了有效群体历史动态演变,为解析伯乐树濒临因素和未来保护提供了重要参考。
提交者 刘刚
提交时间 2024/7/5 16:06:15
联系方式 2217786138@qq.com

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杨勇志,张涵等 (2024). 伯乐树的基因组数据 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=2a5d35fb-4e22-55db-0448-2667e9b8c63d