资源信息
| 主题 | XDB大尺度区域生物多样性 |
| 项目类型 | XDB大尺度区域生物多样性 |
| 项目名称 | 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局 |
| (子)课题名称 | 中国西南山地物种形成机制研究 |
| 标题 | 基于核，质体和线粒体数据集的基因组尺度被子植物系统发育相关实验分析数据 |
| 作者 | 刘建全，胡红印等 |
| 关键词 | 被子植物核基因，系统发育 |
| 摘要 | 收集整理了近20年发表的366个高质量被子植物de novo基因组，包含241属，97科和43目。根据三套基因组类型的全基因组水平的序列变化，第一次将同一物种的三套基因组各自的同源序列分别用于被子植物系统发育分析，构建了真正意义上的基因组被子植物系统发育 (GAP)。与转录组或简化基因组数据相比 ，de novo基因组中提取了更准确，更多的“同源”核基因序列；也避免了不同基因组比较时，使用不同物种导致的不可比较性；还将研究结果与基于更大抽样覆盖率，但只依赖一种基因组数据的结果进行了比较 。研究结果揭示了不同基因组数据系统发育冲突中的关键节点和关键类群，并对其可能的原因，如不完全谱系筛选，杂交和基因组加倍导致的非直系同源基因提取等进行了讨论。同时，也使用多化石位点，基于核基因组数据建立了被子植物关键节点的时间分化框架。 |
| 提交者 | 刘刚 |
| 提交时间 | 2024/5/10 11:47:15 |
| 联系方式 | 2217786138@qq.com |
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