资源信息
| 主题 | XDB大尺度区域生物多样性 |
| 项目类型 | XDB大尺度区域生物多样性 |
| 项目名称 | 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局 |
| (子)课题名称 | 喀斯特植物多样性起源与适应性进化 |
| 标题 | 斑叶草植物注释分析数据 |
| 标题(英) | Annotation analysis data of Henckelia pumila |
| 作者 | 孔航辉、冯超 |
| 作者(英) | Hanghui Kong, Chao Feng |
| 关键词 | 斑叶草植物， 基因组组装与评估，注释分析报告 |
| 关键词(英) | Henckelia pumila, genome assembly and evaluation, annotation analysis report. |
| 摘要 | 一、基因组组装结论：利用基因组pacbio测序数据，对基因组进行denovo组装，组装结果如下：contig总长为605.04Mbp,contig N50达到5.70Mbp。对组装版本进行多种方法评估，结果均显示基因组一致性、完整性及准确性均较好。 二、 斑叶草植物基因组注释报告：重复序列注释，基因注释（包括基因架构预测和基因功能预测），非编码RNA (neRNA)注释的分析结果。总数据量为2.83G。 |
| 摘要(英) | 1. Genome Assembly Conclusion: Using PacBio sequencing data, the genome was assembled de novo. The assembly results are as follows: the total length of contigs is 605.04 Mbp, with a contig N50 of 5.70 Mbp. Multiple evaluation methods were used to assess the assembly version, and all results indicate good consistency, completeness, and accuracy of the genome. 2. Annotation Report of Henckelia pumila Genome: The annotation report includes results of repetitive sequence annotation, gene annotation (including gene structure prediction and gene function prediction), and non-coding RNA (ncRNA) annotation. The total data volume is 2.83G. |
| 提交者 | 赖玲 |
| 提交时间 | 2024/4/16 10:39:07 |
| 联系方式 | lailing@scbg.ac.cn |
| 文件名 | 大小 | 描述 | 下载次数 | 操作 | |
|---|---|---|---|---|---|
| BYC.anno.rar | 543.03 MB | 0 | 2025/4/30 之后开放共享 | ||
| eburnea.anno.rar | 224.87 MB | 0 | 2025/4/30 之后开放共享 | ||
| tabacum.anno.2.rar | 80.49 MB | 0 | 2025/4/30 之后开放共享 |
|
版权所有 Copyright © 2020-2030 中国科学院昆明植物研究所,All Rights Reserved
地址：中国云南省昆明市蓝黑路132号 邮政编码：650201 电话：0871-65223223 本中心受中国科学院“十三五”信息化建设专项“中国科学院科学数据中心体系建设”和云南省生物医药重大科技专项“生物资源数字化开发应用（202002AA100007）”资助 致谢中国科学院计算机网络信息中心大数据技术与应用发展部 |
