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元数据

主题	XDB大尺度区域生物多样性
项目类型	XDB大尺度区域生物多样性
项目名称	中国西南地区生物多样性的演化历史与格局
(子)课题名称	中国西南山地物种形成机制研究
标题	唐古特大黄的基因组数据
作者	杨勇志，李颖等
关键词	唐古特大黄基因组，蒽醌合成
摘要	大黄是蒽醌的主要来源，但它们是如何合成的仍然很大程度上是未知的。在这里，我们在染色体水平上生成了一个重要的药用大黄 R. tanguticum 的基因组序列组装，其中 2.76 Gb 组装成 11 条染色体。基因组是由最近的两个全基因组复制事件和最近的逆转录转座子爆发形成的。代谢分析表明，主要的蒽醌类药物主要在其根部合成。转录组学分析揭示了一个与蒽醌生物合成高度相关的共表达模块，其中包括关键的查尔酮合酶基因。1个CHS基因，4个CYP450基因和2个参与次级代谢的BGL基因与其他组织相比，根部表达水平显著上调，并聚集在共表达模块中，这意味着它们也可能作为蒽醌生物合成的候选基因。本研究为蒽醌生物合成的遗传基础提供了宝贵的见解，将有助于未来改进大黄的育种实践和农艺特性。
提交者	刘刚
提交时间	2024/7/5 16:04:39
联系方式	2217786138@qq.com

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在线服务URL

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?linkname=bioproject_sra_all&from_uid=746014

引用

当您使用此数据集时，请引用

杨勇志，李颖等 (2024). 唐古特大黄的基因组数据 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=728eda5f-f6d2-4468-609d-1976ea407e45