主题 | XDB大尺度区域生物多样性 |
项目类型 | XDB大尺度区域生物多样性 |
项目名称 | 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局 |
(子)课题名称 | 中国西南山地物种形成机制研究 |
标题 | WGDI软件开发相关数据 |
作者 | 刘建全,孙朋川等 |
关键词 | 共线性分析,WGDI |
摘要 | 研究者开发了一种基于动态规划算法的共线性提取,与MCScanX和JCVI比较分析发现,WGDI保留了更多同源基因对,以鉴定更长,更多的共线性区块。WGDI特别适用于识别频繁的多倍化事件(如基于高质量染色体水平的基因组)。WGDI验证多倍化事件可以采用共线性深度,Ks峰值和系统发育树三种方式。并且在建立系统发育树时,可以提取和采用与特定进化事件相关联的所有共线性同源基因,有助于确定受递归多倍化影响的系统发育实际历史. |
提交者 | 刘刚 |
提交时间 | 2024/5/10 12:01:08 |
联系方式 | 2217786138@qq.com |