中国科学院战略性先导科技专项(A类)项目“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中国科学院战略性先导科技专项(A类)项目“生物多样性与生态安全”

中国科学院信息化专项课题面向“大尺度区域生物多样性格局与生命策略”的科研信息化应用

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来源 XDA泛第三极生物多样性
标题 20181106bBassica.rapa.var.rapa-HiC
作者 段元文
关键词 青藏高原;蔓菁
摘要 蔓菁基因组序列,经过Hi-C测序后的生物信息学分析可以实现将初步组装的基因组草图中的大部分序列定位到染色体,并能够确定这些序列在染色体上的顺序和方向,为获得高质量的序列图谱奠定重要的基础。故课题组通过该技术把蔓菁基因组序列草图中的序列分别划分到同该物种染色体数目一致的群组(Group)中,并且确定每一群组中所有序列的顺序(Order)及方向(Orientation),之后可以结合参考蔓菁基因组、转录组组装序列(EST序列)、近缘物种及遗传图谱数据对划分群组的准确性及序列之间的顺序和方向进行评估。
提交者 杨丹妮
提交时间 2020/5/19 14:04:18
联系方式 yangdanni@mail.kib.ac.cn

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段元文(2020). 20181106bBassica.rapa.var.rapa-HiC. Biodiversity Data Center. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=a3a9e246-d772-9c4c-634a-e932b92725e4