中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用(202002AA100007)

   资源信息
CSTR
公开级别
仅公开元数据
资源类型
超大文件
资源热度
1325 次浏览
共享协议
CC BY 4.0
元数据
主题 XDA泛第三极生物多样性
项目类型 战略性先导科技专项
项目名称 青藏高原植物Hi-C测序数据(2018)
标题 20181106bBassica.rapa.var.rapa-HiC
作者 段元文
关键词 青藏高原;蔓菁
摘要 蔓菁基因组序列,经过Hi-C测序后的生物信息学分析可以实现将初步组装的基因组草图中的大部分序列定位到染色体,并能够确定这些序列在染色体上的顺序和方向,为获得高质量的序列图谱奠定重要的基础。故课题组通过该技术把蔓菁基因组序列草图中的序列分别划分到同该物种染色体数目一致的群组(Group)中,并且确定每一群组中所有序列的顺序(Order)及方向(Orientation),之后可以结合参考蔓菁基因组、转录组组装序列(EST序列)、近缘物种及遗传图谱数据对划分群组的准确性及序列之间的顺序和方向进行评估。
提交者 杨丹妮
提交时间 2020/5/19 14:04:18
联系方式 yangdanni@mail.kib.ac.cn

包含文件
文件名 大小 描述 下载次数 操作
Manjing_H700-H01_good_1.fq 26.16 GB 0 资源仅公开元数据
Manjing_H700-H01_good_2.fq 26.16 GB 0 资源仅公开元数据
在线服务URL
暂无在线服务
引用
当您使用此数据集时,请引用
段元文 (2020). 20181106bBassica.rapa.var.rapa-HiC . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=a3a9e246-d772-9c4c-634a-e932b92725e4