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Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS

中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用（202002AA100007）

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CC BY 4.0
元数据
主题 XDB大尺度区域生物多样性
项目名称 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局
(子)课题名称 中国西南山地物种形成机制研究
标题 荞麦属的基因组数据
作者 刘建全，林豪等
关键词 荞麦基因组，类黄酮形成过程
摘要 荞麦属的两个荞麦物种进行了PicBio HiFi测序，结合HiC数据，得到了两个物种的单倍型基因组（图1）。基于高质量的基因组，作者分别对其进行了结构注释与功能注释。根据单拷贝基因集构建了蓼科内的系统发育，通过计算Ks，重新推导了荞麦属经历的全基因加倍事件。Ks与共线性区块比较结果显示，荞麦属经历了两次属内特异的全基因组加倍事件（图2）。研究发现普通甜荞相对于苦荞在近期发生了大量的LTR-RTs的插入，这可能是导致甜荞基因组显著大于苦荞基因组的原因
提交者 刘刚
提交时间 2024/7/5 16:05:34
联系方式 2217786138@qq.com

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在线服务URL
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?linkname=bioproject_sra_all&from_uid=937607
引用
当您使用此数据集时，请引用
刘建全，林豪等 (2024). 荞麦属的基因组数据 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=b7b9ec23-817c-b98e-3151-c67282f936f3
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