中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用(202002AA100007)

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元数据
主题 XDB大尺度区域生物多样性
项目类型 XDB大尺度区域生物多样性
项目名称 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局
(子)课题名称 喀斯特植物多样性起源与适应性进化
标题 黄毛草莓、绿色草莓和西藏草莓Hi-C辅助植物基因组测序数据
标题(英) Hi-C assisted plant genome sequencing data of Fragaria viridis, F. nilgerrensis, and F. vesca
作者 孔航辉、冯超
作者(英) Hanghui Kong, Chao Feng
关键词 黄毛草莓、绿色草莓和西藏草莓,Hi-C文库构建,数据量评估,Hi-C辅助基因组装,组装评估,测序数据统计,质量控制
关键词(英) Fragaria vesca, F. viridis, and F. nilgerrensis, Hi-C library construction, data volume assessment, Hi-C assisted genome assembly, assembly evaluation, sequencing data statistics, quality control.
摘要 使用测序平台 Illumina HiSeq 2000测序仪对黄毛草莓、绿色草莓和西藏草莓进行DNA检测,在构建文库后进行质量检测,获得测序数据后进行质控,共获得58.8 Gb数据,以fastq格式保存。
摘要(英) DNA sequencing of the hybrid offspring of Fragaria viridis, F. nilgerrensis, and F. vesca were conducted using the Illumina HiSeq 2000 sequencing platform. After library construction and quality control, a total of 58.8 Gb of sequencing data was obtained, saved in fastq format.
提交者 赖玲
提交时间 2024/4/15 14:59:55
联系方式 lailing@scbg.ac.cn

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孔航辉、冯超 (2024). 黄毛草莓、绿色草莓和西藏草莓Hi-C辅助植物基因组测序数据 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=d4e49c71-3d4c-010a-5eb9-b8c13a4f3cf3