主题 | XDB大尺度区域生物多样性 |
项目类型 | 中国科学院战略性先导科技专项(B类) |
项目名称 | 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局 |
(子)课题名称 | 中国西南山地物种形成机制研究 |
标题 | 滇黄杨的基因组数据 |
作者 | 杨勇志,王祯悦等 |
关键词 | 滇黄杨基因组,核型演化 |
摘要 | 我们首先使用常规的序列演化分析,采用了多种分析手段,构建了包含25个真双子叶目的系统发育关系,结果表明:毛茛目是最早演化出来的真双子叶植物,随后是山龙眼目,而黄杨目和昆栏树目互为姊妹分支且与核心真双子叶具有最近的亲缘关系;在核心真双子叶中,菊类和石竹目聚为一个单系,葡萄目,虎耳草目和蔷薇类聚为一个单系:基于树形异质性分析表明,17.73%和16.60%的树形冲突是由于不完全谱系筛选和渐渗引起的。使用了多种方法(KS,共线性基因dot plot,共线性基因建树分析)明确了滇南黄杨经历了一次独立的全基因组加倍事件,且5大分支之间没有共享的加倍事件。 |
提交者 | 刘刚 |
提交时间 | 2024/7/5 16:06:01 |
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