中国科学院昆明植物研究所科学数据中心

Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS

中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用（202002AA100007）

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CSTR:38106.11.1725951244133  
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CC BY 4.0
元数据
主题 XDB大尺度区域生物多样性
项目类型 XDB大尺度区域生物多样性
项目名称 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局
(子)课题名称 中国西南山区针叶树种的辐射分化与物种形成
标题 华山松群体遗传和物种形成
作者 刘艳艳，魏晓新，汪小全
关键词 华山松，转录组，单拷贝核基因，SNP位点
摘要 该数据集包括华山松群体及其近缘物种共计67个转录组原始数据信息、CDS序列和矩阵、分别利用串联法和溯祖法建立的系统发育树、SNP多态性位点建立的vcf文件以及由四个单拷贝基因ARAL、FTL1、LEA和LFY一代数据分别形成的矩阵。
提交者 weixx@ibcas.ac.cn
提交时间 2024/11/12 10:06:30
联系方式 weixx@ibcas.ac.cn

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文件名 大小 描述 下载次数 操作
2_CDS序列.zip 435.34 MB 0
3_CDS矩阵.zip 35.79 MB 0
4_Tree.zip 15.36 KB 0
5_vcf.zip 200.50 KB 0
6_一代数据矩阵.zip 91.51 KB 0
ParEnBM_R1.fastq.gz 2.48 GB 0
ParEnBM_R2.fastq.gz 2.50 GB 0
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ParEnBM02_R2.fq.gz 2.39 GB 0
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ParEnBM04_R2.fq.gz 2.32 GB 0
ParEnCS_1.fq.gz 2.05 GB 0
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ParEnKD02_R1.fq.gz 2.22 GB 0
ParEnKD02_R2.fq.gz 2.41 GB 0
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PwanEnMLP3_2.fq.gz 2.31 GB 0
SRR原始数据及NCBI网址.xlsx 12.89 KB 0
华山松群体遗传和物种形成数据说明.docx 17.69 KB 0
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Liu YY, Jin WT, Wei XX, Wang XQ. Cryptic speciation in the Chinese white pine (Pinus armandii): Implications for the high species diversity of conifers in the Hengduan Mountains, a global biodiversity hotspot. Mol Phylogenet Evol. 2019 Sep;138:114-125. doi: 10.1016/j.ympev.2019.05.015.

刘艳艳，魏晓新，汪小全 (2024). 华山松群体遗传和物种形成 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=e9865965-75c5-db47-9ae9-b44cab41bf50
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