中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用(202002AA100007)

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主题 XDB大尺度区域生物多样性
项目类型 中国科学院战略性先导科技专项(B类)
项目名称 中国西南地区生物多样性的演化历史与格局
(子)课题名称 中国西南山地物种形成机制研究
标题 四数獐牙菜的基因组数据
作者 刘建全,朱铭佳等
关键词 四数獐牙菜基因组,花的二态性,极端适应和繁殖
摘要 单个植物花的二态性在植物的极端适应和繁殖中起着关键作用,具有很高的生态和进化意义。然而,这种分化和维持背后的组学基础在很大程度上仍然未知。我们旨在通过对高山二年生植物Sinoswertia tetraptera(龙胆科)的二态花进行基因组,转录组和代谢组学分析来研究这一点。首先为四数獐牙菜组装了高质量的染色体水平基因组(903 Mb),其中注释了 31,359 个蛋白质编码基因。鉴定出了最近两轮独立的全基因组复制(WGD)。最近物种特异性WGD的许多基因被发现在两种类型的花中差异表达,这可能有助于这种创新性状的起源。花间表达差异的基因与激素,花色素(类胡萝卜素和类黄酮)和环烯醚化合物的生物合成有关,这些激素与花的发育和颜色都有关系。代谢组学分析同样表明,这两种花中这些化学物质的浓度不同。多个基因之间的表达相互作用可能共同导致该物种中二态花的形态和化学浓度以及开放与封闭授粉,以确保繁殖。
提交者 刘刚
提交时间 2024/8/20 16:17:04
联系方式 2217786138@qq.com

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刘建全,朱铭佳等 (2024). 四数獐牙菜的基因组数据 . Scientific Data Center, Kunming Institute of Botany, CAS. https://data.iflora.cn/Home/DataContent?data_gd=f0c3df69-4deb-ae5c-82f8-9cc58f765e07