中科院战略性先导科技专项(A类)“气候变化对生物多样性的影响与适应策略”

中科院战略性先导科技专项(A类)“生物多样性与生态安全”

生物资源数字化开发应用(202002AA100007)

   数据列表

川黔千金榆的基因组数据

数据集作者: 杨勇志,杨潇月 数据集关键词: 川黔千金榆,染色体级别基因组

数据集摘要:

我们对鹅耳枥Carpinus fangiana的基因组进行了测序。基于超过 75 Gb (~200x) 的高质量二代测序数据,我们组装了一个 386.19 Mb 的 C. fangiana... 访问数据>>

葱属的转录组数据

数据集作者: 刘建全,李敏洁等 数据集关键词: 葱属转录组,多倍体物种形成

数据集摘要:

研究利用生态适应性,系统发育基因组学,基因组水平的旁系同源基因分化,简化基因组与多基因位点的群体基因组数据,和荧光原位杂交(GISH和FISH)分析,系统阐述了该四倍体韭的适应性和复杂起源... 访问数据>>

四川金粟兰的基因组数据

数据集作者: 杨勇志,马健翔等 数据集关键词: 金粟兰基因组,WGD,花发育

数据集摘要:

报道了一个来自金粟兰目的物种四川金粟兰的高质量参考基因组。作者检测到了一次特异于四川金粟兰的全基因组复制事件,发现不同核心被子植物支系中的多倍化事件都是相互独立的。作者还发现尽管四川金粟兰... 访问数据>>

伯乐树的基因组数据

数据集作者: 杨勇志,张涵等 数据集关键词: 伯乐树基因组,WGD,基因功能

数据集摘要:

伯乐树又名钟萼木,山桃花,为第三纪孑遗植物,隶属于叠珠树科(Akaniaceae)。伯乐树以中国为分布中心,零星散布于长江以南省区的森林中,1999年被列为国家一级重点保护野生植物。结合二... 访问数据>>

滇黄杨的基因组数据

数据集作者: 杨勇志,王祯悦等 数据集关键词: 滇黄杨基因组,核型演化

数据集摘要:

我们首先使用常规的序列演化分析,采用了多种分析手段,构建了包含25个真双子叶目的系统发育关系,结果表明:毛茛目是最早演化出来的真双子叶植物,随后是山龙眼目,而黄杨目和昆栏树目互为姊妹分支且... 访问数据>>

杨属的基因组数据

数据集作者: 李敏洁,张涵等 数据集关键词: 杨属重测序数据,基因渐渗

数据集摘要:

Populus alba (Pa),P. tremula (Pt) 和P. tremuloides (Ps) 是杨属的三个树种,在系统发育树中没有直接关系,Pa 最早分化,其次是 Pt 和... 访问数据>>

荞麦属的基因组数据

数据集作者: 刘建全,林豪等 数据集关键词: 荞麦基因组,类黄酮形成过程

数据集摘要:

荞麦属的两个荞麦物种进行了PicBio HiFi测序,结合HiC数据,得到了两个物种的单倍型基因组(图1)。基于高质量的基因组,作者分别对其进行了结构注释与功能注释。根据单拷贝基因集构建了... 访问数据>>